MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nanoarchaeum equitans Kin4-M chromosome

Total Repeats: 12716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005213	T	6	6	14	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005213	TCTT	2	8	91	98	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005213	TA	4	8	145	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005213	ATTCTT	2	12	170	181	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_005213	CTT	2	6	222	227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005213	TTC	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005213	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005213	TCCA	2	8	363	370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005213	TTC	2	6	403	408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005213	CTTT	2	8	420	427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_005213	T	6	6	425	430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005213	TTC	2	6	451	456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005213	T	7	7	571	577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005213	TTA	2	6	612	617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005213	TTTTA	2	10	628	637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005213	ATA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005213	TAT	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005213	T	7	7	712	718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005213	TAAAAT	2	12	729	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005213	TCTT	2	8	746	753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_005213	T	6	6	782	787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005213	AT	3	6	789	794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005213	T	6	6	832	837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005213	AT	3	6	916	921	50 %	50 %	0 %	0 %	41614798
25	NC_005213	AGA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614798
26	NC_005213	AAT	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614798
27	NC_005213	TTC	2	6	1032	1037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41614798
28	NC_005213	AGC	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41614798
29	NC_005213	TAA	2	6	1079	1084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614798
30	NC_005213	TAA	2	6	1091	1096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614798
31	NC_005213	AAG	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614798
32	NC_005213	TAT	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614798
33	NC_005213	CAA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41614798
34	NC_005213	A	7	7	1365	1371	100 %	0 %	0 %	0 %	41614798
35	NC_005213	AAAG	2	8	1386	1393	75 %	0 %	25 %	0 %	41614798
36	NC_005213	TGT	3	9	1401	1409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41614798
37	NC_005213	AG	3	6	1467	1472	50 %	0 %	50 %	0 %	41614798
38	NC_005213	CAA	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41614798
39	NC_005213	TCCA	2	8	1520	1527	25 %	25 %	0 %	50 %	41614798
40	NC_005213	TTTG	2	8	1548	1555	0 %	75 %	25 %	0 %	41614798
41	NC_005213	TA	3	6	1585	1590	50 %	50 %	0 %	0 %	41614798
42	NC_005213	TTTC	2	8	1598	1605	0 %	75 %	0 %	25 %	41614798
43	NC_005213	TA	3	6	1628	1633	50 %	50 %	0 %	0 %	41614798
44	NC_005213	ATATA	2	10	1646	1655	60 %	40 %	0 %	0 %	41614798
45	NC_005213	AAG	2	6	1664	1669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614798
46	NC_005213	A	6	6	1711	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	41614798
47	NC_005213	A	6	6	1780	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	41614798
48	NC_005213	AT	3	6	1806	1811	50 %	50 %	0 %	0 %	41614798
49	NC_005213	AGA	2	6	1839	1844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614798
50	NC_005213	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614798
51	NC_005213	ACTTCT	2	12	1897	1908	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	41614798
52	NC_005213	TAGAT	2	10	2010	2019	40 %	40 %	20 %	0 %	41614798
53	NC_005213	TAGA	2	8	2048	2055	50 %	25 %	25 %	0 %	41614798
54	NC_005213	AAT	2	6	2076	2081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614798
55	NC_005213	TAG	2	6	2159	2164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41614798
56	NC_005213	AGAA	2	8	2177	2184	75 %	0 %	25 %	0 %	41614798
57	NC_005213	TAA	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614798
58	NC_005213	A	6	6	2305	2310	100 %	0 %	0 %	0 %	41614798
59	NC_005213	AAT	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614798
60	NC_005213	TATT	2	8	2370	2377	25 %	75 %	0 %	0 %	41614798
61	NC_005213	GAA	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614798
62	NC_005213	TA	3	6	2420	2425	50 %	50 %	0 %	0 %	41614798
63	NC_005213	ATA	2	6	2432	2437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614798
64	NC_005213	GAA	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614798
65	NC_005213	TA	3	6	2525	2530	50 %	50 %	0 %	0 %	41614798
66	NC_005213	AT	3	6	2545	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	41614798
67	NC_005213	AG	3	6	2647	2652	50 %	0 %	50 %	0 %	41614798
68	NC_005213	A	6	6	2662	2667	100 %	0 %	0 %	0 %	41614798
69	NC_005213	AG	4	8	2670	2677	50 %	0 %	50 %	0 %	41614798
70	NC_005213	TAT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614799
71	NC_005213	TTC	2	6	2734	2739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41614799
72	NC_005213	TAA	2	6	2817	2822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614799
73	NC_005213	T	7	7	2829	2835	0 %	100 %	0 %	0 %	41614799
74	NC_005213	ATGG	2	8	2844	2851	25 %	25 %	50 %	0 %	41614799
75	NC_005213	CCAT	2	8	2906	2913	25 %	25 %	0 %	50 %	41614799
76	NC_005213	ACT	2	6	2918	2923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41614799
77	NC_005213	CACTAT	2	12	2971	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41614799
78	NC_005213	ATT	3	9	3010	3018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614799
79	NC_005213	AATTCT	2	12	3026	3037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	41614799
80	NC_005213	T	6	6	3039	3044	0 %	100 %	0 %	0 %	41614799
81	NC_005213	CTT	2	6	3048	3053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41614799
82	NC_005213	ATT	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614799
83	NC_005213	TAT	2	6	3081	3086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614799
84	NC_005213	TA	3	6	3166	3171	50 %	50 %	0 %	0 %	41614799
85	NC_005213	TAA	2	6	3198	3203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005213	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005213	AT	3	6	3224	3229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005213	GCG	2	6	3236	3241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_005213	G	6	6	3246	3251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005213	CCCT	2	8	3325	3332	0 %	25 %	0 %	75 %	41614800
91	NC_005213	CCATG	2	10	3351	3360	20 %	20 %	20 %	40 %	41614800
92	NC_005213	CTT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41614800
93	NC_005213	T	6	6	3377	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	41614800
94	NC_005213	TTC	2	6	3460	3465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41614800
95	NC_005213	T	6	6	3471	3476	0 %	100 %	0 %	0 %	41614800
96	NC_005213	A	6	6	3482	3487	100 %	0 %	0 %	0 %	41614800
97	NC_005213	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	41614800
98	NC_005213	AT	3	6	3523	3528	50 %	50 %	0 %	0 %	41614800
99	NC_005213	TTTCTA	2	12	3574	3585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	41614800
100	NC_005213	T	6	6	3586	3591	0 %	100 %	0 %	0 %	41614800
101	NC_005213	CAT	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41614800
102	NC_005213	AT	3	6	3620	3625	50 %	50 %	0 %	0 %	41614800
103	NC_005213	AAT	2	6	3727	3732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614800
104	NC_005213	TTTA	2	8	3811	3818	25 %	75 %	0 %	0 %	41614801
105	NC_005213	T	7	7	3832	3838	0 %	100 %	0 %	0 %	41614801
106	NC_005213	GATA	2	8	3886	3893	50 %	25 %	25 %	0 %	41614801
107	NC_005213	TC	3	6	3895	3900	0 %	50 %	0 %	50 %	41614801
108	NC_005213	GTTTT	2	10	3947	3956	0 %	80 %	20 %	0 %	41614801
109	NC_005213	TAA	2	6	3970	3975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614801
110	NC_005213	ATT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614801
111	NC_005213	CTA	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41614801
112	NC_005213	AT	3	6	4116	4121	50 %	50 %	0 %	0 %	41614801
113	NC_005213	CT	3	6	4249	4254	0 %	50 %	0 %	50 %	41614801
114	NC_005213	CTA	2	6	4260	4265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41614801
115	NC_005213	TAT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614801
116	NC_005213	CTTTT	2	10	4339	4348	0 %	80 %	0 %	20 %	41614801
117	NC_005213	TAT	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614801
118	NC_005213	TAT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614801
119	NC_005213	AAT	2	6	4385	4390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614801
120	NC_005213	ATAG	2	8	4473	4480	50 %	25 %	25 %	0 %	41614801
121	NC_005213	CCTC	2	8	4508	4515	0 %	25 %	0 %	75 %	41614801
122	NC_005213	T	6	6	4516	4521	0 %	100 %	0 %	0 %	41614801
123	NC_005213	TCTAT	2	10	4526	4535	20 %	60 %	0 %	20 %	41614801
124	NC_005213	TAA	2	6	4555	4560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614801
125	NC_005213	TCT	2	6	4597	4602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41614801
126	NC_005213	A	6	6	4613	4618	100 %	0 %	0 %	0 %	41614801
127	NC_005213	TA	3	6	4619	4624	50 %	50 %	0 %	0 %	41614801
128	NC_005213	ATTT	2	8	4664	4671	25 %	75 %	0 %	0 %	41614801
129	NC_005213	T	6	6	4693	4698	0 %	100 %	0 %	0 %	41614802
130	NC_005213	CTA	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41614802
131	NC_005213	A	6	6	4764	4769	100 %	0 %	0 %	0 %	41614802
132	NC_005213	TAT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614802
133	NC_005213	AT	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	41614802
134	NC_005213	AGCT	2	8	4879	4886	25 %	25 %	25 %	25 %	41614802
135	NC_005213	TTA	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614802
136	NC_005213	TAA	2	6	4948	4953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614802
137	NC_005213	TTA	2	6	4969	4974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614802
138	NC_005213	A	6	6	5019	5024	100 %	0 %	0 %	0 %	41614802
139	NC_005213	A	6	6	5060	5065	100 %	0 %	0 %	0 %	41614802
140	NC_005213	TTCT	2	8	5106	5113	0 %	75 %	0 %	25 %	41614803
141	NC_005213	TAAA	2	8	5134	5141	75 %	25 %	0 %	0 %	41614803
142	NC_005213	AAT	2	6	5151	5156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614803
143	NC_005213	A	6	6	5209	5214	100 %	0 %	0 %	0 %	41614803
144	NC_005213	ATT	2	6	5260	5265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614803
145	NC_005213	TA	3	6	5307	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	41614803
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425	NC_005213	TTTAT	2	10	15131	15140	20 %	80 %	0 %	0 %	41614812
426	NC_005213	TA	3	6	15165	15170	50 %	50 %	0 %	0 %	41614813
427	NC_005213	CTTTA	2	10	15211	15220	20 %	60 %	0 %	20 %	41614813
428	NC_005213	AAAAG	2	10	15233	15242	80 %	0 %	20 %	0 %	41614813
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430	NC_005213	TAT	2	6	15379	15384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614813
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432	NC_005213	TTTAGT	2	12	15423	15434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	41614813
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434	NC_005213	TGA	2	6	15543	15548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41614813
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438	NC_005213	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	41614813
439	NC_005213	TA	3	6	15692	15697	50 %	50 %	0 %	0 %	41614813
440	NC_005213	AG	3	6	15702	15707	50 %	0 %	50 %	0 %	41614813
441	NC_005213	AGG	2	6	15715	15720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41614813
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443	NC_005213	TAT	2	6	15767	15772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614813
444	NC_005213	T	6	6	15825	15830	0 %	100 %	0 %	0 %	41614813
445	NC_005213	CTTTAG	2	12	15857	15868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	41614813
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447	NC_005213	A	6	6	15994	15999	100 %	0 %	0 %	0 %	41614813
448	NC_005213	TAA	2	6	16017	16022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614813
449	NC_005213	TA	3	6	16078	16083	50 %	50 %	0 %	0 %	41614813
450	NC_005213	TTA	2	6	16152	16157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614813
451	NC_005213	TTA	2	6	16166	16171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_005213	GTTT	2	8	16214	16221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_005213	TAA	2	6	16258	16263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_005213	TAAT	2	8	16348	16355	50 %	50 %	0 %	0 %	41614814
455	NC_005213	TTA	2	6	16410	16415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614814
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457	NC_005213	AGA	2	6	16521	16526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614814
458	NC_005213	A	6	6	16564	16569	100 %	0 %	0 %	0 %	41614814
459	NC_005213	GAAG	2	8	16570	16577	50 %	0 %	50 %	0 %	41614814
460	NC_005213	TTAC	2	8	16584	16591	25 %	50 %	0 %	25 %	41614814
461	NC_005213	GTT	2	6	16602	16607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41614814
462	NC_005213	GAA	2	6	16615	16620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614814
463	NC_005213	TATC	2	8	16654	16661	25 %	50 %	0 %	25 %	41614814
464	NC_005213	GGA	2	6	16666	16671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41614814
465	NC_005213	TTA	2	6	16681	16686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614814
466	NC_005213	TAA	2	6	16722	16727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614814
467	NC_005213	GTG	2	6	16799	16804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41614814
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472	NC_005213	AAAAG	2	10	17009	17018	80 %	0 %	20 %	0 %	41614814
473	NC_005213	ATTAC	2	10	17024	17033	40 %	40 %	0 %	20 %	41614814
474	NC_005213	ATA	2	6	17095	17100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41614814
475	NC_005213	TA	3	6	17122	17127	50 %	50 %	0 %	0 %	41614814
476	NC_005213	TAT	2	6	17179	17184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41614814
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484	NC_005213	TCAAT	2	10	17523	17532	40 %	40 %	0 %	20 %	41614814
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486	NC_005213	A	6	6	17557	17562	100 %	0 %	0 %	0 %	41614814
487	NC_005213	ATG	2	6	17628	17633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41614814
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489	NC_005213	AAG	2	6	17835	17840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614815
490	NC_005213	A	6	6	17915	17920	100 %	0 %	0 %	0 %	41614815
491	NC_005213	A	6	6	17984	17989	100 %	0 %	0 %	0 %	41614815
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499	NC_005213	AGA	3	9	18260	18268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41614815
500	NC_005213	A	7	7	18273	18279	100 %	0 %	0 %	0 %	41614815

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